南普陀寺始建于唐朝末年，稱為泗洲寺，宋治平年間改名為普照寺，明朝初年，寺院荒蕪，直到清朝康熙年間才得到重建。因其供奉觀世音菩薩，與浙江普陀山觀音道場(chǎng)類似，又在普陀山以南而得名“南普陀寺”，為閩南佛教勝地之一。